Разъяснение этого вопроса содержится в письме Федеральной налоговой службы № ГД-4-3/25567 от 10 декабря 2014 года.

На основании подпункт 14.1 пункта 2 статьи 149 Налогового кодекса России, от уплаты НДС освобождаются услуги по организации и проведению физкультурных и спортивных мероприятий. Определение таких мероприятия установлено Федеральным законом «О физической культуре и спорте в Российской Федерации» от 4 декабря 2007 года (статья 2 закона 329-ФЗ). В соответствии с ним, спортивным мероприятием являются соревнования спортсменов, а также тренировочные и другие мероприятия по подготовке к ним. К физкультурному мероприятию относится организация занятий граждан физкультурой, то есть деятельностью, направленной на развитие физических способностей, двигательной активности, формирование ЗОЖ.

Таким образом, если услуги ООО по организации физической подготовки граждан соответствуют указанной в статье 2 закона 329-ФЗ деятельности, то при их осуществлении компания от уплаты НДС освобождается.