В соответствии с пунктом 1 статьи 172 Налогового кодекса, входной налог с приобретенных основных средств может быть принят к вычету (возмещению) в том периоде, когда имущество было поставлено на учет. При том условии, что оно используется в облагаемой НДС деятельности, а продавец оформил счет-фактуру с выделением суммы налога. Вычет входного НДС по основным средствам осуществляется в полном объеме, без дробления и переноса на последующие периоды.

Таким образом, ИП следовало принять НДС с приобретения транспортного средства к вычету сразу после его покупки и оприходования. Сейчас же вычитать оплаченный ранее налог оснований нет.