Если оставшиеся товары будут продаваться с НДС, то можно будет заявить входной налог к вычету. Но нужно найти счета фактуры, полученные от поставщиков этих товаров.

Далее процедура такова. Нужно убедиться, что на момент реализации товара с даты выставления по нему счета-фактуры не прошло трех лет. Если это так, то согласно пункту 1.1 статьи 172 НК РФ, НДС можно заявить к вычету. В книге продаж следует зарегистрировать счет-фактуру, полученную от поставщика. При этом указывается сумма входного НДС, которая приходится на именно этот проданный товар.